WIPO于2004年2月12日开始启用PCT-SAFE (Secure Applications Filed Electronically)系统。该系统投入使用后，PCT 123个成员国的申请人均可按300瑞郎的下调费用提交PCT申请。

“PCT历史上的这一里程碑开创了PCT业务的新纪元，它将成为国际专利制度的基石”，负责PCT工作的WIPO副总干事弗朗西斯?加利先生说，“PCT－SAFE系统确保了电子申请的安全性，加快了PCT申请的受理和处理，并将为该系统的用户及WIPO带来巨大效益”。

使用PCT-SAFE系统提交电子申请可为申请人带来的益处是：1)费用可降低300瑞郎；2)由于PCT-SAFE系统软件的编制符合PCT要求的文件，可确保申请格式正确无误；3)减少了申请文件的印刷、复制和邮寄费；4)申请已被受理并正被处理的通知可立即发出；5)不论申请文件处于PCT程序期间还是进入公共领域，均可对文件进行充分检索；6) 为了保证国际申请的安全传送，WIPO客户证明主管局向使用PCT－SAFE系统的申请人出具的数字化证明具有高度的数据完整性及安全性。

在WIPO受理局全面开通PCT-SAFE意味着 PCT用户从此既可通过在线方式亦可通过CD-R介质提交国际申请。可以说PCT-SAFE系统在其试验阶段后，进入了PCT用户和WIPO对其进行检测和评估的新阶段。

到目前为止，大部分PCT申请还只能以纸件形式提交。在向电子申请过渡期间，申请人可使用PCT-SAFE软件编拟一份有效的请求书表格，并将该请求书(可采用纸件，也可采用磁盘)与纸件形式的该申请实质内容一并提交。PCT-SAFE产品是在PCT-EASY软件升级版的基础上完成的。PCT-EASY用户享受了费用下调100瑞郎的优惠，而PCT-SAFE用户将从最高可达300瑞郎的下调费用中得到实惠。

有关PCT-SAFE最新发展情况，可登录WIPO的PCT网站http://www.wipo.int/pct-safe/en/index.htm进行查询，也可以查阅PCT Newsletter和 WIPO 杂志。此外WIPO还出版了一本题为《什么是PCT-SAFE?》的出版物 (参考号496)，可供参考。